Средняя школа № 18 была образована 4 сентября 1971 года.

1993 г. - Средняя школа № 18 была переименована в Муниципальное общеобразовательное учреждение сад-школа-лицей № 18.

2000 г. - Муниципальное общеобразовательное учреждение средняя общеобразовательная школа № 18.

2001 г. -  Муниципальное общеобразовательное учреждение гимназия № 18 г. Томска

2010 г. - гимназия получила статус Муниципальное автономное общеобразовательное учреждение гимназия № 18 г.Томска